GALNT7将dMMR/MSI结肠直肠癌分层为与预后和PD-L1表达相关的不同分子子集

科学领域:

• 分子瘤学分子瘤学
• 癌症基因组学 癌症基因组学
• 免疫治疗生物标志物 免疫治疗生物标志物

背景情况:

• 缺陷不匹配修复 (dMMR) /微卫星不稳定 (MSI) 结直肠癌 (CRC) 是一种对免疫检查点抑制剂敏感的独特亚型.
• 在dMMR/MSI CRC中,预后和治疗反应各不相同,因此需要改进患者分层标记.
• 研究了癌细胞内在的糖系转移酶表达特征,以确定新的生物标志物.

研究的目的:

• 在结直肠癌中基于不匹配修复 (MMR) 状态的差异表达的癌细胞内在葡萄糖转移酶的识别.
• 在大型CRC队列中评估已识别的糖转移酶的临床和预后相关性.
• 探索GALNT7表达,PD-L1水平和dMMR/MSI CRC中的生存结果之间的关系.

主要方法:

• 单细胞,批量和细胞系RNA测序数据集的综合分析,以分析188个甘氨基转移酶基因.
• 对662名dMMR/MSI和3,483名熟练的不匹配修复 (pMMR) /微卫星稳定 (MSS) CRC患者的转录组,蛋白组和免疫组织化学 (IHC) 数据的分析.
• 功能测定和莱克微阵列分析,以调查GALNT7敲击对PD-L1表达的影响.

主要成果:

• 包括GALNT7在内的五个甘氨基转移酶,根据MSI状态显示出一致的表达差异.
• 一个五基因甘氨基转移酶签名有效地区分MSI和MSSCRC在18个数据集中.
• 在dMMR/MSI CRC中,GALNT7表达与良好的预后有关,并且与该亚组内的PD-L1表达相反相关.
• 在MSI CRC细胞系中,GALNT7敲击增强了IFNγ诱导的PD-L1表达.

结论:

• GALNT7表达作为一个分子标记物,将dMMR/MSI结直肠癌分层为不同的亚型.
• 这些亚型表现出差异性瘤细胞PD-L1表达和明显的生存结果.
• GALNT7具有作为预后生物标志物的潜力,可以指导dMMR/MSI CRC中的治疗策略.