使用英国生物库数据对体力活动和结直肠癌的遗传易感性进行全基因组相互作用研究

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 在瘤学瘤学.
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 结肠直肠癌 (CRC) 的风险是多因素的,涉及遗传倾向和生活方式因素,如体力活动 (PA).
• 了解基因环境相互作用对于个性化CRC预防策略至关重要.

研究的目的:

• 进行全基因组相互作用研究 (GWIS),探索单核酸多态 (SNP) 和受PA影响的基因与CRC风险相关.
• 分析PA和CRC风险之间的基因水平和通路水平的关联.

主要方法:

• 利用了来自272270名参与者的英国生物库数据,包括2979例CRC病例和11435例匹配对照.
• 采用发生密度匹配用于控制选择,以最大限度地减少偏差.
• 应用条件后勤回归用于SNP x PA相互作用分析和聚合SNP结果用于基因水平分析.

主要成果:

• 几个SNP显示了PA的名义相互作用信号 (p <5x10-6),包括ABI3,ZBTB16和GABRB3附近的位置,但没有一个幸存FDR校正.
• 基因层面的分析确定了RNASEL,NSD1和efferocytosis通路的标称信号,这些信号在校正后也没有达到统计学意义.
• 观察到的实例中,相互作用和主要影响是相反的方向.

结论:

• 在多次测试校正后,这项研究没有确定PA和CRC风险的统计学上显著的基因环境相互作用.
• 初步发现表明,在特定位置和路径上存在潜在的,尽管在统计上不强大的关联,因此需要进一步调查.
• 强调了在结直肠癌病因学中基因生活方式相互作用的复杂性.