高通量磁珠方法和聚乙烯糖沉对污水中的病毒度的比较效率

科学领域:

• 环境微生物学
• 病毒学
• 分子生物学

背景情况:

• 污水监测提供了有关社区感染率的见解.
• 有效的病毒度方法对于基于废水的准确流行病学至关重要.
• 基于磁珠的核酸提取是一种广泛采用的高效技术.

研究的目的:

• 为了确定污水中基于磁珠的病毒度的最佳预处理.
• 将磁珠度的效率与传统的聚乙烯糖醇 (PEG) 沉进行比较.
• 评估磁珠方法对各种包裹和非包裹病毒的性能.

主要方法:

• 使用磁珠方法测试了三种预处理方法 (沉积,低速离心,高速离心).
• 使用严重急性呼吸系统冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 进行了急性恢复测试.
• 使用真实污水样本来评估SARS-CoV-2,流感病毒,诺罗病毒,罗塔病毒和腺病毒的丰富性.

主要成果:

• 低速离心 (2500×g 5分钟) 被确定为磁珠度的最佳预处理方法.
• 与PEG沉相比,磁珠方法显示SARS-CoV-2,诺罗病毒和腺病毒的恢复率显著更高.
• 该方法在缩包裹和非包裹病毒方面被证明是有效的.

结论:

• 经过低速离心预处理的优化磁珠方法,可提高污水中的病毒度.
• 这种高通量方法适用于各种病毒病原体的废水监测.
• 在环境病毒学研究中,磁珠度比PEG沉率显著提升.