全基因组测序和Trametes sanguinea ZHSJ的注释
Rathna Silviya Lodi1,2, Xiuwen Jia1, Peng Yang3
1Key Laboratory of Agro-Products Processing Technology of Shandong Province, Key Laboratory of Novel Food Resources Processing Ministry of Agriculture, Institute of Food & Nutrition Science and Technology, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, 250100, China.
Scientific data
|August 21, 2025
概括
这项研究介绍了栗子木的真菌Trametes sanguinea ZHSJ的整个基因组和转录组序列. 基因组数据为了解其潜在的好处和功能提供了基础.
科学领域:
- 菌群学
- 基因组学
- 转录组学
背景情况:
- 血菌是一种多菌家族的真菌.
- 它的果实体以各种有益的特性而闻名.
研究的目的:
- 进行全基因组和转录基因组测序.
- 标注基因组和转录组以获得功能性见解.
主要方法:
- 全基因组测序和组装.
- 进行RNA测序和转录组合.
- 使用多个数据库和Funannotate进行基因注释.
- 简单的序列重复 (SSR) 分析
主要成果:
- 红血虫ZHSJ的基因组大小为41.32 Mb,有135个结合体.
- 从基因组序列中注释了10886个基因.
- 转录组分析发现了11861个基因,其中10507个被注释.
- 丹诺沃的预测发现了12268个编码基因.
- 总共发现了1242个SSR,其中包括707个三核酸重复基因.
结论:
- 基因组和转录组数据为研究Trametes sanguinea提供了宝贵的资源.
- 这些基本数据有助于了解这种真菌的生物功能和潜在应用.


