用于从环境和生物样本中分类亚微生物细胞和病毒的式分类器的制备
Jamie C Tijerina1,2, Francisco Martinez-Hernandez3,4,2, Vera Beilinson1
1Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, California, USA.
Current protocols
|August 22, 2025
概括
本协议详细说明了BD FACSAria细胞分类器用于亚微米样本分类,包括病毒样粒子和细菌. 它确保了清洁的流体和样本准备,
科学领域:
- 细胞生物学
- 基因组学
- 生物技术
背景情况:
- 像病毒样粒子 (VLP) 和细菌这样的亚微粒处于大多数流细胞计的检测极限.
- 这些小颗粒的精确分类和下游基因组分析需要仔细的仪器准备和样品处理.
- 现有的协议可能无法充分解决从这些小样本中分类和保存遗传物质的独特挑战.
研究的目的:
- 为准备BD FACSAria细胞分类器 (II/III/Fusion) 用于分类微米样本提供一个全面的协议.
- 建立共享资源实验室和个人研究人员处理VLP和细菌样本的工作流程.
- 确保高质量的DNA恢复下游应用,如全基因组放大和测序.
主要方法:
- 准备BD FACSAria II/III/Fusion细胞分类器的流体系统的详细说明,包括液的准备和仪器的净化.
- 清洁和维护水箱,容器和仪器喷嘴的协议,以尽量减少污染.
- 关于软件设置,电压优化和微粒分类的关门策略的指导.
- 制备无DNA液体和溶液以防止遗传物质的污染.
主要成果:
- 使用BD FACSAria细胞分类器对包括VLP和细菌在内的亚微米样本进行分类的验证工作流程.
- 通过优化流体和样本准备,尽量减少噪音和改善小颗粒的检测极限.
- 减少基因组污染的风险,使得下游高通量全基因组放大和测序成功.
结论:
- 这套协议为准备BD FACSAria细胞分类器进行亚微米样本分析提供了可靠的方法.
- 详细的程序确保了小样本的遗传材料的完整性,这对于基因组研究至关重要.
- 工作流程可适应各种共享资源实验室设置,并与其他BD Biosciences基管分类器兼容.


