通过免疫组织化学表达MTAP:非小细胞肺癌的新生物标志物
Magdalena M Brune1, Luca Roma1, Obinna Chijioke1
1Pathology, Institute of Medical Genetics and Pathology, University Hospital Basel, University of Basel, Schönbeinstrasse 40, 4031 Basel, Switzerland.
概括
甲基氨酸酸酶 (MTAP) 缺乏发生在18. 2%的非小细胞肺癌 (NSCLC) 中,最好通过免疫组织化学 (IHC) 进行评估. 在NSCLC中,CDKN2A损失是MTAP损失的不可靠替代物.
科学领域:
- 癌症学
- 分子诊断
- 癌症生物标志物
背景情况:
- 甲基氨酸酸酶 (MTAP) 损失是向治疗和免疫检查点抑制剂的预测生物标志物.
- 评估MTAP状态对于临床试验中的患者分层和治疗选择至关重要.
- 非小细胞肺癌 (NSCLC) 占胸部恶性瘤的很大一部分,其中MTAP变化可能会影响治疗反应.
研究的目的:
- 通过免疫组织化学 (IHC) 确定非小细胞肺癌 (NSCLC) 中MTAP缺乏症的流行率.
- 评估基于下一代测序 (NGS) 的CDKN2A拷贝数变异 (CNV) 作为MTAP损失的替代标记的实用性.
- 将IHC与NGS的可靠性进行比较,以评估NSCLC中的MTAP状态.
主要方法:
- 在698个NSCLC样本上进行MTAP免疫组织化学 (IHC).
- 从426个病例中分析了常规下一代测序 (NGS) 数据,包括CDKN2A拷贝数变异 (CNV).
- 与癌症基因组图谱 (TCGA) 队列数据进行比较.
主要成果:
- 在18. 2%的NSCLC病例中,IHC检测出MTAP缺乏.
- 通过NGS检测到的CDKN2A损失与MTAP缺乏有关,但仅在28%的MTAP缺乏NSCLC中存在.
- 在TCGA队列中,有27. 1%的CDKN2A损失的NSCLC没有同时出现MTAP损失.
结论:
- 免疫组织化学 (IHC) 是比OncomineTM精度检测 (OPA-NGS) 更合适的方法,用于评估NSCLC中的MTAP状态.
- CDKN2A损失不是MTAP损失的可靠替代品,因为它可以高估MTAP缺乏.
- 在NSCLC的临床决策中,MTAP IHC提供了更准确的MTAP状态评估.
