探索6-aza-2-thiothymine作为一种MALDI-MSI矩阵,用于形式素固定的对嵌入的临床样本的空间脂组学
Natalia Shelly Porto1, Simone Serrao1, Greta Bindi1
1Department of Medicine and Surgery, Proteomics and Metabolomics Unit, University of Milano-Bicocca, 20854 Vedano al Lambro, Italy.
这项研究表明,6-aza-2-thiothymine (ATT) 是一种有效的矩阵,用于在甲固定嵌 (FFPE) 组织中对脂质进行矩阵辅助激光吸附/电离质谱成像 (MALDI-MSI). 在临床样本中进行详细的脂质映射,有助于疾病研究.
科学领域:
- 生物医学质谱
- 脂质组学
- 分子病理学
背景情况:
- 脂质在疾病的发病,进展和结果中起着关键作用.
- 矩阵辅助激光吸附/电离质谱成像 (MALDI-MSI) 可以直接从组织中进行空间分辨的脂质分析.
- 有效的MALDI矩阵选择对于在具有挑战性的样本中进行敏感脂质分析至关重要,例如固定甲嵌入 (FFPE) 组织.
研究的目的:
- 在FFPE临床样本中评估6-aza-2-thiothymine (ATT) 作为脂质MALDI-MSI的矩阵
- 将ATT的性能与已建立的矩阵 (DHB,NOR) 进行脂质分析.
- 根据脂质概况,评估ATT在区分正常和癌症组织方面的有用性.
主要方法:
- 在脂质标准上对ATT,DHB和NOR进行比较分析.
- 在FFPE脑部部分使用ATT在正离子和负离子模式中的脂质的MALDI-MSI分析.
- 在FFPE质母细胞瘤组织微阵列 (TMA) 上应用ATT以进行本质病理相关性.
主要成果:
- 在FFPE脑部部分,ATT能够对98种脂质进行假定注释,并平衡地检测出糖脂和脂.
- 与DHB相比,ATT在识别糖脂和脂肪酸方面表现优于DHB和NOR,并且显示出更高的脂类多样性.
- 在FFPE样本中,ATT成功地发现了能够区分质母细胞瘤与正常大脑组织的脂质特征.
结论:
- 即使在高侧分辨率 (20 μm) 中,ATT也是 lipidomic MALDI-MSI 适用于病理学的矩阵.
- 通过从同一组织部分分析脂质和质,ATT的使用为多组学研究提供了战略优势.
- 支持积极和负电离模式的脂质组分析,增强其在FFPE组织分析中的多功能性.
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