全基因组关联和精细映射分析使用猪的归算全基因组测序数据来确定影响血清皮质醇水平的新型候选基因
Tae-Hee Kim1, Hyeon-Ah Kim2, Jae-Bong Lee3
1Department of Animal Resources Science, Kongju National University, Yesan 32439, Korea.
Journal of animal science and technology
|August 28, 2025
概括
研究人员确定了与猪皮质醇水平相关的基因, 这对于旨在增强压力抵抗力和改善动物健康和生产力的育种计划至关重要. 这种基因洞察力有助于培养更强壮的猪种群.
科学领域:
- 动物遗传学
- 基因组学
- 动物养殖
背景情况:
- 养猪计划需要选择适应环境压力因素影响生产力.
- 皮质醇水平由下丘脑-垂体-上腺轴调节,是生物应激反应,猪强度和健康的关键指标.
研究的目的:
- 确定影响猪血液皮质醇水平的定位候选基因和遗传变异.
- 提高猪的强度和抗压能力的选择策略.
主要方法:
- 在Duroc x韩国本土猪的F2资源种群 (243只动物) 上进行全基因组关联研究 (GWAS).
- 联合链接和链接不平衡 (LALD) 映射和贝叶斯精细映射分析,使用归算的全基因组测序数据.
- 在猪染色体7上的重要定量特征位点 (QTL) 中识别候选基因.
主要成果:
- 在染色体7上检测到全基因组显著的皮质醇水平,解释了12. 65%的表型变异.
- 精细映射分析确定了候选基因,包括QTL区域内的SERPINA1,ITPK1,CLMN,SERPINA12,PRIMA1和SERPINA6.
- 确定了与血清皮质醇度相关的定位候选基因和遗传变异.
结论:
- 已识别的基因和变体可以纳入基因组预测标记面板.
- 这项研究支持在养殖计划中改进猪的强度和应激抵抗力的选择策略.


