转录组分析揭示了子肌肉内脂肪沉积的关键基因和调节网络
Hui Wang1, Yuan Chen1, Chengcheng Zhao1
1Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Shaanxi Province, College of Animal Science and Technology, Northwest A&F University, Yangling, 712100, China.
BMC genomics
|August 28, 2025
概括
雷克斯的肌肉内脂肪 (IMF) 沉积量高于Hycole,STARD13,HSPB8和CBLB被确定为影响这种特性的关键基因. 这项研究揭示了与子脂肪发育相关的动态转录变化.
科学领域:
- 动物科学
- 基因组学
- 肉类科学
背景情况:
- 肌肉内脂肪 (IMF) 显著影响子肉的质量,影响软度,多汁度和味道.
- 了解IMF沉积对于提高子肉的特性至关重要.
- 这项研究集中在Hycole和Rex子品种的长背肌 (LD) 上.
研究的目的:
- 评估Hycole和Rex子的生长,屠宰性能和肉质特征.
- 识别影响IMF含量的差异表达基因 (DE mRNA) 和长非编码RNA (DE lncRNA).
- 构建 lncRNA-mRNA 调节网络以了解雷克斯的脂肪发育.
主要方法:
- 对不同生长阶段的Hycole和Rex子进行比较分析.
- 全转录组测序以识别DE mRNA和DE lncRNA.
- 构建 lncRNA-mRNA 调节网络和信号通路的丰富分析 (Wnt,TGF-β,PPAR).
- 短时间序列表达矿工 (STEM) 和权重基因共表达网络分析 (WGCNA) 的应用
主要成果:
- 两种品种的IMF含量随着年龄的增长而增加,雷克斯比海科尔的含量更高.
- 鉴定出一些与脂肪沉积相关的DE mRNA (例如,KCNQ5,POSTN) 和DE lncRNA.
- 丰富分析将已识别的基因与重要的脂肪沉积途径联系起来.
- 包括STARD13,HSPB8和CBLB在内的10个lncRNA-mRNA目标基因对被确定为IMF沉积的关键调节者.
结论:
- 确定STARD13,HSPB8和CBLB是负责子IMF沉积的关键基因.
- 在子中,IMF沉积与显著和动态的转录变化有关.
- 这些发现为遗传育种策略和了解子脂肪发育提供了基础.
