复杂基因位点中的功能调节元件的内生精细映射和优先级
Ke Zhao1, Yao Zhou2, Xueqi Wang3
1Guangzhou Women and Children's Medical Center, Guangzhou Medical University, Guangzhou, China; State Key Laboratory of Experimental Hematology, The Province and Ministry Co-sponsored Collaborative Innovation Center for Medical Epigenetics, Department of Bioinformatics, School of Basic Medical Sciences, Tianjin Medical University, Tianjin, China; Center for Public Health Laboratory Testing, School of Public Health, Shandong Second Medical University, Weifang, Shandong, China.
大多数复杂特征的遗传原因都隐藏在非编码DNA中. 这项研究揭示了影响基因表达的完美链接不平衡 (pLD) 的多个调节元件,揭示了以前隐藏的遗传机制.
科学领域:
- 基因组学
- 分子生物学
- 表观遗传学
背景情况:
- 多基因特征的遗传位置通常存在于非编码区域.
- 复杂的调节和链接不平衡 (LD) 阻碍了因果变异和基因识别.
研究的目的:
- 调查紧密的LD中的cis调节元素 (CRE) 和基因表达关系.
- 发现细粒度的基因对基因表达的影响,
主要方法:
- 多重化单细胞CRISPR干扰和激活干扰.
- 内生染色体背景和多细胞表观遗传和序列数据的分析.
主要成果:
- 在独立表达量化特征位点 (eQTL) 的完美LD (pLD) 中证明了多重因果关系的流行.
- 在pLD中确定细粒度的基因影响.
- 发现超过三分之一的因果CREs缺乏扰乱前的经典表观遗传标记.
- 在功能上验证了一个隐藏的监管机制.
结论:
- 突出了人类基因组的调节性可塑性.
- 在分子特征调节和疾病发展中指导因果机制的探索.
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