一个染色体层面的基因组组合 Omiodes indicata Fabricius (Lepidoptera: Crambidae)
Xiuxian Shen1, Feiran Wang1, Jie Hu1
1Institute of Entomology, Guizhou Key Laboratory of Agricultural Biosecurity, College of Agriculture, Guizhou University, Guiyang, 550025, China.
Scientific data
|August 29, 2025
概括
组建了影响粮食安全的豆类害虫Omiodes indicata的高质量基因组. 这种基因组资源有助于了解其生态,并制定有效的害虫管理策略.
科学领域:
- 基因组学
- 分子生态学
- 害虫管理
背景情况:
- 虫是一种重要的豆类害虫,威胁着热带和亚热带地区的粮食安全.
- 对O. indicata的有限基因组数据阻碍了生态和管理研究.
研究的目的:
- 为了生成Omiodes indicata的高质量基因组组.
- 为分子生态学和害虫管理研究提供基础资源.
主要方法:
- 使用PacBio HiFi长读,Illumina短读和Hi-C测序技术.
- 进行基因组组合和基因预测.
- 使用BUSCO分析评估基因组的完整性.
主要成果:
- 通过59个支架 (N50:17.25 Mb) 实现了493.08 Mb的基因组组合,定在31个染色体上.
- 基因组完整性很高 (99.1%的BUSCO检测),预测了14713个蛋白质编码基因.
- 在基因组中,重复元素占38.13%.
结论:
- 高质量的O. indicata基因组是分子生态学的宝贵资源.
- 这些基因组数据将促进对这一重要的豆类害虫的现代化防治策略的开发.
