在的脂肪组织中建立超级增强器景观
Fang Mu1, Yang Jing1, Jiarui He1
1College of Animal Science and Technology, Northeast Agricultural University, Harbin, China; Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Education Department of Heilongjiang Province, Harbin, China; Key Laboratory of Chicken Genetics and Breeding, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, China.
研究人员在肉脂肪组织中发现了278种脂肪细胞特异性超级增强剂 (ASSEs),揭示了参与脂肪形成的关键基因和途径. 这项研究为的脂肪生成提供了新的见解.
科学领域:
- 基因组学
- 分子生物学
- 动物科学
背景情况:
- 超级增强剂 (SE) 对细胞特征至关重要,并在哺乳动物脂肪发育中发挥重要作用.
- 脂细胞特异性SE (ASSEs) 在全基因组水平上尚未进行全面研究.
- 了解ASSE对于了解的脂肪生成和脂肪沉积至关重要.
研究的目的:
- 在全基因组水平上对的脂肪组织进行系统性鉴定.
- 确定与 ASSE 相关的基因和调控途径.
- 探索ASSE在脂沉积和相关特征中的作用.
主要方法:
- 在的脂肪组织中使用了H3K4me1,H3K27ac和PPARγ结合概况的目标和标记 (CUT&Tag).
- 集成的CUT&Tag数据用于识别ASSE和相关基因 (ASSEAGs).
- 进行功能丰富,基因表达分析,转录因子结合部位分析和定量特征位点 (QTL) 叠加分析.
主要成果:
- 在的脂肪组织中确定了278个与1,129个基因相关的ASSE (ASSEAGs).
- ASSEAG参与了PI3K-Akt,PPAR,Hippo和JAK-STAT等重要的信号通路.
- 在选定的肉品种中,有93个ASSEAG与差异表达的基因重叠,ASSE与1,125个与特征相关的QTL重叠.
结论:
- 提供了第一个全面的全基因组性质测试.
- 强调ASSE在调节的脂肪生成和脂肪组织发育方面的重要性.
- 提供了对脂肪沉积和相关特征的分子机制的新见解.
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