机器学习分析揭示了乳腺癌中的瘤异质性和肌体免疫
Junjie Kuang1, Guofang Zhong2, Linfeng Zhao2
1Cancer Center, Huizhou First Hospital, Huizhou, Guangdong, China.
NPJ digital medicine
|September 2, 2025
概括
这项研究揭示了低度乳腺癌中特定的细胞亚型, 尽管具有有利特征, 矛盾地降低了免疫疗法的反应. 了解瘤微环境的异质性是克服治疗耐药性的关键.
科学领域:
- 癌症学
- 免疫学
- 基因组学
背景情况:
- 乳腺癌仍然是癌症死亡的主要原因.
- 瘤异质性和耐药性存在重大治疗挑战.
研究的目的:
- 通过综合的多组学方法分析BRCA样本.
- 识别瘤微环境中的细胞群及其功能.
- 了解免疫规避和治疗抗性的机制.
主要方法:
- 单细胞RNA测序,空间转录和大量RNA-seq解卷的整合.
- 乳腺癌样本中主要细胞群的识别和表征.
- 分析特定细胞亚型的空间定位和功能作用.
主要成果:
- 发现了15个主要的细胞群,包括瘤上皮细胞,免疫细胞,肌细胞和内皮细胞.
- 低度瘤显示有丰富的亚型 (CXCR4+纤维细胞,IGKC+骨髓细胞,CLU+内皮细胞),具有明显的空间和免疫调节功能.
- 这些低度亚型与免疫治疗反应的降低有悖论的联系.
- 高度瘤显示重新编程的细胞间通信与扩展的MDK和Galectin信号.
- 大量RNA-seq解卷证实了低度丰富亚型的预后意义.
结论:
- 乳腺癌表现出显著的瘤微环境异质性.
- 低度瘤中的特定细胞亚型可能会损害免疫治疗反应,尽管临床特征有利.
- 了解这些亚型对于开发克服乳腺癌免疫逃避和治疗耐药性的策略至关重要.
