MRMAssayDB:针对蛋白质组测试的综合资源
Yassene Mohammed1,2,3, Pallab Bhowmick3, Christoph H Borchers1,3,4,5,6
1Gerald Bronfman Department of Oncology, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montreal, Quebec, Canada.
Expert review of proteomics
|September 3, 2025
概括
通过MRMAssayDB整合了向蛋白质组测定数据,简化了蛋白质的量化. 这一综合平台为研究人员提供了可验证的和过渡数据,简化了测试选择和小组组建.
科学领域:
- 蛋白质组学
- 生物信息学
- 生物技术
背景情况:
- 使用多重反应监测 (MRM) 和并行反应监测 (PRM) 等方法的定向定量蛋白质学对于精确的蛋白质测量至关重要.
- 开发和验证针对蛋白质组的测试是耗时的,尽管存在数据库.
- MRMAssayDB集成了来自多个来源的精选的向蛋白质组测试数据.
研究的目的:
- 创建一个针对蛋白质组测试数据的综合平台.
- 改善验证的蛋白型和过渡数据的可访问性和可用性.
- 为研究人员提供高效的测试选择和定量小组开发.
主要方法:
- 在MRMAssayDB平台上汇总和注释向蛋白质组测试数据.
- 最新发布 (2021) 包含了超过110万个对939,000个的测定,涵盖了146种生物中的61,000个蛋白质.
- 一个新的可视化模块将样映射到Alphafold预测的3D蛋白质结构和蛋白质数据库 (PDB) 结构.
主要成果:
- 通过MRMAssayDB,可以访问超过110万个向蛋白质组测试.
- 该数据库将蛋白质与19,000个基因实体学术语和4,000个生物途径联系起来.
- 综合可视化工具允许对3D蛋白质结构的位,修饰和突变进行检查.
结论:
- 通过MRMAssayDB,可获得有效的向蛋白质组测试.
- 该平台简化了测试选择和构建量化小组的过程.
- 该资源支持研究人员推进定量蛋白质组学研究.
更多相关视频
11:09An HS-MRM Assay for the Quantification of Host-cell Proteins in Protein Biopharmaceuticals by Liquid Chromatography Ion Mobility QTOF Mass Spectrometry
Published on: April 17, 2018
10.3K
11:49Quantitative Proteomics Workflow using Multiple Reaction Monitoring Based Detection of Proteins from Human Brain Tissue
Published on: August 28, 2021
4.6K
