空间异质性揭示了预测肝细胞癌治疗反应和临床结果的进化特征
Shangyi Luo1, Li Liu1, Yang Sun2
1Interdisciplinary Institute for Medical Engineering, Fuzhou University, Fuzhou, Fujian, China.
Frontiers in bioinformatics
|September 3, 2025
概括
肝细胞癌 (HCC) 的瘤内异质性可以预测患者的结果. 开发的HCC进化特征 (HCCEvoSig) 提供可靠的预后信息,并预测HCC患者的治疗反应.
科学领域:
- 癌症学
- 基因组学
- 翻译医学
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 具有显著的瘤内异质性.
- 了解HCC瘤中的转录组差异对于预测患者的发展轨迹和疾病演变至关重要.
研究的目的:
- 调查HCC中的瘤内转录组异质性是否可用于开发患者结果的预测特征.
- 开发和验证HCC进化特征 (HCCEvoSig) 用于HCC的预后评估.
主要方法:
- 在四个HCC群体 (172个样本,37名患者) 中量化了转录组异质性.
- 使用单细胞转录基因分析 (110,817个细胞,34个标本) 验证异质性和空间动态.
- 在六个跨平台的HCC群体中开发和评估HCCEvoSig.
主要成果:
- HCCEvoSig基因在HCC预后相关基因组中显示出显著的瘤内部和瘤内部表达变异.
- 单细胞数据证实了HCCEvoSig基因异质性和从非瘤到瘤区域的逐渐空间过渡.
- 高 HCCEvoSig 风险评分预测了 HCC 进展和死亡风险的增加,优于现有的特征并预测了治疗反应.
结论:
- 在HCC瘤中的区域转录异质性包含显著的生存信号.
- 经过验证的HCCEvoSig为HCC患者提供了可靠的预后信息和预测实用性,有助于临床决策.
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