甲状腺眼病中与氧化压力相关的生物标志物:生物信息学分析和实验验证的证据
Yuanping Hai1,2, Qintao Ma1, Zhitao Liu3
1Department of Endocrinology and Metabolism, The Eighth Affiliated Hospital of Southern Medical University (The First People's Hospital of Shunde Foshan), Foshan, Guangdong, China.
Frontiers in immunology
|September 3, 2025
概括
这项研究确定了三种与氧化压力相关的基因是甲状腺眼病 (TED) 的潜在生物标志物. 这些通过免疫组织化学验证的生物标志物可以改善TED的早期查和风险评估.
科学领域:
- 眼科 眼科
- 免疫学
- 遗传学
背景情况:
- 甲状腺眼病 (TED) 的发病包括氧化应激,但分子机制和生物标志物尚不清楚.
- 生物信息学有助于基因发现,但验证至关重要,以避免假阳性.
- 免疫组织化学验证蛋白质表达,并将分子发现与临床表现联系起来.
研究的目的:
- 识别和验证与氧化压力相关的基因作为甲状腺眼病 (TED) 的潜在生物标志物.
- 通过使用多组数据, 探索氧化应激在TED病变中的作用.
- 开发一个TED风险评估的预测模型.
主要方法:
- 鉴定了与氧化应激相关的差异表达基因 (OS-DEG),并进行了基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径分析.
- 利用机器学习 (LASSO,随机森林) 选择关键的诊断基因,并构建了一个风险预测的名录.
- 使用免疫组织化学验证了轨道组织中关键基因/蛋白质 (FOS,MCL1,ANGPTL7) 的表达.
主要成果:
- 在氧化应激和线粒体通路中显著丰富的53个OS- DEG被确定.
- 选择了5个诊断基因 (AKT1,APEX1,FOS,MCL1,ANGPTL7),一个组合模型的AUC为0.931.
- 与对照组织相比,TED组织的FOS,MCL1和ANGPTL7显著上调.
结论:
- 这项研究首次确定和验证了三种与氧化压力相关的基因/蛋白质作为潜在的TED生物标志物.
- 这些已验证的生物标志物为TED的病原性提供了新的见解.
- 这些生物标志物可以促进早期查和甲状腺眼病风险评估.
