与过敏性鼻炎相关的免疫生物标志物的识别和样本诊断模型的开发
MaoMeng Wang1,2,3,4, Shuang Wang1,2,3,4, XinHua Lin1,2,3,4
1Qingdao University Affiliated Yantai Yuhuangding Hospital, Yantai, Shandong Province, China.
PloS one
|September 3, 2025
概括
这项研究确定了过敏性鼻炎 (AR) 的关键免疫生物标志物,并开发了一种五基因诊断模型. 该模型在区分AR患者方面具有很高的准确性,为临床诊断和治疗策略提供了潜力.
科学领域:
- 免疫学
- 生物信息学
- 基因组学
背景情况:
- 过敏性鼻炎 (AR) 造成严重的健康负担,需要改进诊断工具.
- 目前的AR诊断方法可能缺乏特异性和敏感性.
- 确定强大的免疫相关生物标志物对于准确的AR诊断和管理至关重要.
研究的目的:
- 鉴定与过敏性鼻炎 (AR) 相关的免疫相关生物标志物.
- 使用已识别的生物标志物开发和验证AR的诊断模型.
- 根据关键基因探索潜在的治疗目标.
主要方法:
- 使用R包对两个血液CD4+T细胞数据集 (GSE5010,GSE50223) 的综合分析.
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 以确定与疾病相关的基因模块.
- 不同基因表达分析 (limma),通路丰富 (DAVID,GSEA) 和网络构建 (STRING).
- 使用LASSO回归和支持矢量机 (SVM) 开发诊断模型,并使用ROC曲线进行验证.
主要成果:
- 在AR和对照组的28种免疫细胞类型中,有8种显著差异.
- 鉴定了326个差异表达基因 (DEG),其中257个与WGCNA识别的基因重叠.
- 在与免疫相关的途径中增加DEG,例如"细胞因子-细胞因子受体相互作用".
- 一个五基因签名 (RFC4,LYN,IL3,TNFRSF1B,RBBP7) 实现了0.843 (训练) 和0.739 (验证) 的诊断效率.
结论:
- 一个五基因诊断模型显示出强大的AR预测能力.
- 已确定的生物标志物和模型有可能用于AR诊断的临床应用.
- 这项研究为过敏性鼻炎的新诊断和治疗策略铺平了道路.
