核酸代谢和免疫基因可以预测肝细胞癌的预后风险和免疫微环境
Xiaofang Wang1,2, Qinghua Cui1,3, Yuan Zhou1
1Department of Biomedical Informatics, School of Basic Medical Sciences, Peking University, Beijing 100191, China.
Biology
|September 4, 2025
概括
这项研究引入了用于肝细胞癌 (HCC) 预后的新九基因特征,整合了核酸代谢和免疫基因. 这种工具可以改善生存预测,并识别可能受益于免疫治疗的患者.
科学领域:
- 癌症学
- 免疫学
- 基因组学
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 的整体存活率较低,因此需要改善预后标志物.
- 核酸代谢和瘤免疫微环境对于HCC的进展和治疗反应至关重要.
- 目前缺乏将这些因素结合起来进行HCC预测的综合模型.
研究的目的:
- 通过结合核酸代谢和免疫相关基因,开发和验证肝细胞癌 (HCC) 的综合预后特征.
- 根据这些综合分子特征将HCC患者分为不同的亚型.
- 评估签名预测预后,免疫微环境状态和免疫治疗反应的能力.
主要方法:
- 利用TCGA-LIHC的转录和临床数据来识别核酸代谢和与免疫相关的差异表达基因 (NMIRG).
- 使用非负矩阵因子对患者分层和LASSO/Cox回归来构建九基因预后风险特征.
- 使用独立的GEO数据集,HCC细胞系中的RT-qPCR和人类蛋白质图谱 (HPA) 数据库验证了签名.
主要成果:
- 一个9基因的NMIRG签名有效地将HCC患者分为高风险和低风险组.
- 高风险患者显示免疫细胞概况发生变化,瘤突变负担增加,微卫星不稳定,免疫治疗预测反应较差.
- 该标志显示出独立的预后价值,超越现有模型,并准确预测免疫微环境状态和治疗益处.
结论:
- 综合的NMIRG信号可为肝细胞癌 (HCC) 提供更好的预后.
- 这种特征是预测免疫治疗反应和指导个性化HCC治疗的有希望的生物标志物.
- 这些发现突显了核酸代谢和免疫因素在HCC进展和患者结局之间的相互作用.
