使用pMHC伪型病毒和酵母显示器对TCR抗原接口进行深度映射
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|September 5, 2025
概括
一种新的方法VelociRAPTR快速选数以百万计的T细胞受体 (TCR) 与抗原的相互作用. 它映射了TCR序列如何影响抗原识别,帮助T细胞治疗的发展和预测非目标效应.
科学领域:
- 免疫学
- 分子生物学
- 生物技术
背景情况:
- 对于有效的T细胞疗法,T细胞受体 (TCR) 的特异性至关重要.
- 目前用于绘制TCR抗原相互作用的方法缺乏可扩展性.
- 了解TCR序列功能关系对于治疗发展至关重要.
研究的目的:
- 开发一种可扩展的方法来对不同抗原绘制TCR特异性.
- 调查TCR序列变化,特别是CDR3循环中的变化,如何影响抗原识别.
- 为工程和预测建模提供TCR抗原相互作用的深度,高通量数据.
主要方法:
- 引入VelociRAPTR,一个图书馆对图书馆的选方法.
- 使用酵母显示的TCR库和MHC显示病毒样粒子 (pMHC-VLPs).
- 对数百万个TCR变异的同时查多个pMHC,包括CDR3循环和的突变.
主要成果:
- 通过pMHC- VLP与酵母表现的TCR有效结合,获得与复合pMHC蛋白相比较的数据.
- VelociRAPTR成功选了4700万个TCR变异与92个pMHC.
- 生成了详细的CDR3-pMHC地图,揭示了CDR3循环突变如何调节特异性,从而实现选择性约束或扩大识别.
结论:
- VelociRAPTR为高通量蛋白-蛋白相互作用绘制提供了一个可通用的策略.
- 生成的地图为设计具有量身定制的pMHC结合配置文件的TCR提供了洞察力.
- 这种方法增强了在T细胞治疗中预测TCR抗原相互作用和非标识别的模型.
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