基于竞争性内源性RNA的免疫相关的长非编码RNA的鉴定
Yuexuan Xu1, Lingxian Liu1, Yinquan Chen1
1Intelligent Systems and Optimization Integration, School of Automation, Guangdong University of Technology, Guangzhou, China.
International dental journal
|September 6, 2025
概括
这项研究确定CARD8-AS1是脉中关键的免疫相关的长非编码RNA (lncRNA). CARD8-AS1及其ceRNA网络对于免疫反应的调节至关重要,并可作为诊断标记物.
科学领域:
- 口腔生物学
- 免疫学
- 生物信息学
- 分子生物学
背景情况:
- 牙炎是一种影响牙健康的普遍炎症性口腔疾病.
- 了解分子机制,特别是免疫失调, 对于治疗肺炎至关重要.
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 在炎症疾病中的作用越来越被认可.
研究的目的:
- 通过生物信息学方法识别出与免疫相关的 lncRNA.
- 通过竞争的内源性RNA (ceRNA) 网络阐明这些lncRNA的功能作用.
- 根据与免疫相关的 lncRNA 探索肺炎的潜在诊断生物标志物.
主要方法:
- 来自患者和健康牙纸样本的 lncRNA 的差异表达分析.
- 用于分类模型开发的 LASSO 回归.
- 单样基因组丰富分析 (ssGSEA) 和权重基因相关网络分析 (WGCNA) 以确定与免疫相关的lncRNA及其功能.
- 使用miRanda,TargetScan和miRDB数据库构建一个lncRNA-miRNA-mRNA网络.
主要成果:
- 建立了一个5-lncRNA分类模型; 确定CARD8-AS1和LINC00924具有显著的免疫相关性.
- WGCNA表示CARD8-AS1和LINC00924与免疫丰富模块相关.
- 建立了一个以CARD8-AS1为中心的ceRNA网络,突出显示了与参与JAK-STAT信号传递的免疫相关基因 (PTGS2,NLRP3,CXCL3) 的相互作用.
结论:
- lncRNA CARD8- AS1及其相关的 ceRNA 网络在肌肉炎期间调节免疫反应方面发挥着重要作用.
- 免疫相关的 lncRNAs,特别是 CARD8-AS1, 显示出作为 pulpitis 的新型非侵入性诊断标记物的潜力.
- 对CARD8-AS1的调控功能进行进一步的研究可以为皮炎提供新的治疗点.
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