基于单细胞RNA序列测序的肝细胞癌中与热致死相关的基因的预后模型构建和免疫微环境分析
Haoming Shen1, Yizhi Peng1, Qingqing Xie2
1Department of Clinical Laboratory, Hunan Cancer Hospital & The Affiliated Cancer Hospital of Xiangya School of Medicine, Central South University, Changsha, Hunan, China.
Frontiers in immunology
|September 8, 2025
概括
这项研究开发了一种用于肝细胞癌 (HCC) 的预后模型,使用通过单细胞分析识别的灭相关基因 (PRG). 该模型预测了患者的结果和免疫治疗反应,为个性化HCC治疗提供了一个工具.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 的预后因瘤异质性和免疫抑制微环境而复杂化.
- 在单细胞分辨率下,HCC中热的预后意义仍未得到充分研究.
研究的目的:
- 系统地研究使用单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 的HCC中与热致死相关的基因 (PRG) 的预后意义.
- 根据PRG开发和验证基于HCC的预后模型.
主要方法:
- 来自10个HCC瘤和相邻组织 (60,496个细胞) 的scRNA-seq数据的分析,以确定PRG概况.
- 使用TCGA LIHC队列数据 (n=365) 开发LASSO-Cox预后模型,并使用ICGC数据集 (n=231) 进行外部验证.
- 使用RT-PCR和免疫组织化学进行生物验证.
主要成果:
- 确定了10个具有丰富PRG表达的细胞群,主要在免疫细胞 (NK细胞,T淋巴细胞,单细胞,巨细胞) 中.
- 开发了一种8基因预后模型,将患者分为高风险和低风险组,AUC为0.73,0.65和0.69,总生存期为1-3年.
- 高风险患者对免疫治疗的敏感性增加,由较低的TIDE得分和较高的PD-1/CTLA4表达率表明.
结论:
- 建立了基于PRG的scRNA-seq衍生的预后模型,提供了对HCC免疫景观重塑的见解.
- 风险评分和名谱作为临床工具,用于个性化的预后和治疗向在HCC.
