在先进的NSCLC中下一代测序的诊断准确性

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 分子诊断学 分子诊断学

背景情况:

• 综合的基因组分析对高级非小细胞肺癌 (NSCLC) 治疗指导至关重要.
• 基于组织的下一代定向面板测序 (TP-NGS) 面临着诸如组织采样不足等挑战.
• 从血液中循环的瘤DNA (ctDNA) 为基因组分析提供了一个有前途的替代方案.

研究的目的:

• 评估血型TP-NGS与组织型TP-NGS的诊断准确性,用于高级NSCLC患者.
• 评估ctDNA瘤分数 (TF) 对基于血液的TP-NGS敏感度和准确性的影响.
• 为了确定ctDNA分析是否可以在某些临床场景中有效地取代组织活检.

主要方法:

• 在精确瘤学计划中对561名晚期NSCLC患者进行前性分析.
• 进行基于组织 (FoundationOne®CDx) 和基于血液 (FoundationOne®Liquid CDx) 的TP-NGS.
• 评估了诊断准确性,重点是灵敏度,阳性百分比一致性 (PPA) 和血液和组织之间的瘤突变负担 (TMB) 的相关性,通过ctDNATF分层.

主要成果:

• 在配对队列中的50.2%的患者中发现了可操作的突变,EGFR突变占主导地位.
• 高ctDNATF (>1%) 显示可操作突变100%的PPA,而低ctDNATF (<1%) 显示47.5%的PPA.
• 基于血液的TMB (bTMB) 与基于组织的TMB (tTMB) 在高ctDNATF组 (r=0.71) 与低TF组 (r=0.13) 相比显示出强烈的相关性.
• 对于bTMB的PPA在高ctDNATF组 (92.3%) 与低TF组 (31.3%) 相比显著更高.

结论:

• 基于血液的TP-NGS对于检测高级NSCLC中可操作的突变非常准确,特别是当ctDNATF高时.
• 这种液体活检方法可以作为组织活检的可行替代方案,当瘤组织的获取具有挑战性或不足时.
• ctDNA TF是影响NSCLC血基基因组分析诊断产量和可靠性的关键因素.