邻居聚类分析,以定义上皮层 - 肌接口,用于瘤透淋巴细胞评估

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 免疫学 免疫学 免疫学
• 计算病理学计算病理学

背景情况:

• 目前瘤透淋巴细胞的评估侧重于树皮区域,忽视了上皮区域和上皮-树皮接口.
• 手动细胞识别的技术挑战阻碍了在上皮瘤细胞混合物中的免疫细胞的评估.
• 这种限制可能会影响对免疫检查点疗法的患者反应评估.

研究的目的:

• 应用监督邻近集群分析 (CytoMAP) 来量化妇科瘤中的免疫细胞分布.
• 评估CD8+ T细胞,耗尽的CD8+ TIM3+ T细胞和CD8- TIM3+巨细胞的空间分布.
• 为了比较免疫细胞密度在上皮层,层层和上皮层-层层接口隔间.

主要方法:

• 利用CytoMAP,一个开源应用程序,用于监督的社区集群分析.
• 应用了三分区模型 (上皮,面膜,接口) 来分割瘤.
• 在妇科瘤微阵列上的CD8+ T细胞,CD8+ TIM3+耗尽的T细胞和CD8- TIM3+巨细胞的量化空间分布.

主要成果:

• 当被纳入三个隔间模型时,上皮层 - 胸膜接口隔间显示了CD8 + T细胞的最高密度.
• 相比之下,传统的两模型主要确定了树皮区域具有最高的CD8+T细胞密度.
• 与CD8+ TIM3- T细胞相比,在接口和上皮区域发现CD8+ TIM3+耗尽的T细胞的比例更高.

结论:

• 定量空间分析和免疫子集分析对于评估瘤透淋巴细胞非常有价值.
• 瘤上皮层-膜接口是免疫细胞透的重要但未得到充分报道的隔间.
• 将接口纳入分析可能会改善对患者对免疫疗法的反应的理解.