一种核酸衍生的光体,用于可视化G-四重复合组合,并引入阴离子调节活动到血栓结合的阿普坦体中

科学领域:

• 生物技术是生物技术.
• 分子生物学分子生物学
• 化学生物学 化学生物学

背景情况:

• 核酸体是合成分子,在生物技术中具有显著的潜力.
• 优化aptamer亲和力和活动对于它们融入纳米设备至关重要.
• 人工核酸类比为aptamer研究提供了工具.

研究的目的:

• 使用人工核酸类似物来增强凝血素结合的阿普坦酶的亲和力.
• 为了研究修改后的体的活性调节.
• 探索内在光的使用,以研究aptamer折叠动态.

主要方法:

• 用7,8-二-8-oxo-1,N6-乙烯丁 (oxo-εA) 结合血栓结合的阿胺的核酸修饰.
• 通过结合试验,研究阿巴 - 氨酸相互作用和亲和力.
• 利用Ag+离子调节胺体活性,研究由此产生的复合体.
• 采用停止流量度法来捕捉阿帕特默折叠动力学.
• 确定具有各种阳离子的聚体复合物的解离常数.

主要成果:

• 在第4位或第13位的单个oxo-εA修改增加了对血栓的aptamer亲和力十倍.
• 在4位和13位的双氧-εA修饰导致了Ag+依赖的体活性.
• Ag+离子形成了一个非正规的oxo-εA:Ag+2:oxo-εA对,模仿了对血栓结合至关重要的自然T:T基对.
• 氧-εA的内在光允许在G-四倍折叠过程中对形状变化的研究.
• 分离常数表明修改对G-四倍折叠的影响最小.

结论:

• 人工核酸类似物,特别是oxo-εA,有效地增强了aptamer亲和力,并使活动调节成为可能.
• 依赖Ag+的阿帕特默系统为控制纳米设备中的阿帕特默功能提供了一个新的机制.
• 修饰核酸的内在光是一种有价值的工具,用于研究体动力学和折叠.