针对性下一代测序的评估,用于检测HPV基因型和亚系在宫液基细胞学SurePath样本从丹麦查计划的检测样本

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 病毒学 病毒学
• 遗传学 遗传学 是一个

背景情况:

• 人类乳头瘤病毒 (HPV) 基因型的致癌性已知,但它们的子系,可能具有不同的风险概况,理解程度较低.
• 使用下一代测序 (NGS) 在查衍生液体细胞学 (LBC) 样本上分析HPV亚系是技术上具有挑战性的,缺乏强大的质量保证.

研究的目的:

• 评估从丹麦宫癌查中SurePath LBC样本中检测14种HPV基因型的HPV亚系的可行性.
• 在临床查背景下建立一种质量可靠的NGS方法,用于HPV亚系分析.

主要方法:

• 从全球HPV LabNetDNA基因型化能力小组2023中利用了41个HPV等离子体,用于NGS质量保证.
• 应用NGS对120个SurePath从宫癌查中的LBC样本进行了概念验证HPV亚系检测.
• 验证了NGS方法对HPV亚系鉴定的准确性和覆盖范围.

主要成果:

• 该NGS方法成功地在99.1%的HPV阳性SurePath LBC样本中识别了HPV亚系.
• 对大多数基因型的HPV等离子体分析证实了正确的亚系鉴定,仅对HPV68b的覆盖范围不足.
• 几种高风险HPV类型 (如HPV16,18,31) 中,A系亚系最常见,而B型亚系在HPV45,56,66中占主导地位.

结论:

• 开发并验证了一种可行的NGS方法,用于直接从SurePath LBC查样本中识别HPV亚系.
• 这种方法为未来研究HPV亚系在宫癌风险分层中的作用提供了关键数据.
• 这些发现支持HPV亚系分析在查计划中管理HPV阳性个体的潜在临床实用性.