关于培养细胞和人工组织的单细胞空间转录形状分析的协议,不进行嵌入或切割
Haylie R Helms1, Luiz E Bertassoni2
1Department of Biomedical Engineering, School of Medicine, Oregon Health and Science University, Portland, OR 97201, USA; Knight Cancer Precision Biofabrication Hub, Knight Cancer Institute, Oregon Health and Science University, Portland, OR 97201, USA; Cancer Early Detection Advanced Research Center, Knight Cancer Institute, Oregon Health and Science University, Portland, OR 97201, USA.
STAR protocols
|September 12, 2025
概括
我们开发了一种新的协议,用于对二维工程组织和细胞培养物的空间转录组分析. 这种方法与Visium HD空间技术兼容,可实现详细的细胞洞察.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 空间转录学揭示了细胞组成和影响细胞行为的空间关系.
- 标准协议通常需要嵌入和切割,限制对2D工程组织和细胞培养物的分析.
研究的目的:
- 介绍一项用于二维工程组织和细胞培养物的空间转录基因分析的新方案.
- 调整现有的方法,使其与Visium HD空间技术兼容.
主要方法:
- 提供了样品生成,固定和染色的详细步骤.
- 该协议是为与标准嵌入和切割不兼容的2D工程组织和细胞培养设计的.
- 与Visium HD空间技术的集成是一个关键功能.
主要成果:
- 一个灵活和有效的协议,用于对具有挑战性的2D样本进行空间转录组分析.
- 空间转录学成功适应工程组织和细胞培养.
- 能够对细胞微环境进行详细的研究.
结论:
- 该协议将空间转录学的应用扩展到更广泛的生物系统.
- 它为研究人员在2D培养和工程组织中研究细胞相互作用提供了有价值的工具.
- 促进对空间基因表达模式的更深入的理解.


