基于三基因签名的口腔状细胞癌的预后风险评分模型的开发和多队列验证

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 生物标志物发现发现

背景情况:

• 口腔状细胞癌 (OSCC) 尽管有手术治疗,但死亡率很高.
• 对于可靠的生物标志物和预后工具来实现个性化的OSCC管理,有着至关重要的需求.

研究的目的:

• 开发和验证一个强大的基因基因预后模型,用于口腔状细胞癌 (OSCC).
• 与现有的分阶段系统相比,识别一种改善风险分层的基因特征.

主要方法:

• 来自TCGA和GEO队列的综合转录和临床数据.
• 利用差异表达分析,WGCNA,PPI,LASSO和随机森林来识别候选基因.
• 使用多变量考克斯模型开发了三基因风险评分,并在多个数据集中验证了它.
• 通过RT-qPCR和Western blot确认基因表达;分析了免疫透和通路.

主要成果:

• 一个三基因签名 (CXCL12,PLAU,PXDN) 在培训和外部验证队列中表现出显著的预后能力.
• 风险评分始终预测高风险OSCC患者的整体存活率较差.
• 综合风险得分和临床变量的一种名录图显示出优于单独TNM分期的优异歧视.
• 实验验证证证实了这三个基因的差异表达.

结论:

• 已经开发了一个强大的,外部验证的OSCC三基因预后模型.
• 这种由实验数据支持的模型提供了比TNM分期更好的预后歧视.
• 为个性化OSCC风险估计提供了一个实用的nomogram,从1到5年.