通过分子对接和分子动力学模拟评估寨卡病毒包膜蛋白的潜在抑制剂
Jehad Zuhair Tayyeb1, Maria Karolaynne da Silva2, Aamal A Al-Mutairi3
1Division of Clinical Biochemistry, Department of Basic Medical Sciences, College of Medicine, University of Jeddah, Jeddah 23890, Saudi Arabia.
Virus research
|September 13, 2025
概括
天然化合物奎尔塞丁,皮诺森布林和纳灵因因通过向病毒E蛋白来表现出作为寨卡病毒 (ZIKV) 抑制剂的前景. 这些黄类药物表现出有利的类似药物的特性和稳定的结合,这需要进一步研究抗病毒疗法.
科学领域:
- 计算化学和药物发现
- 病毒学和传染病学.
- 自然产品化学 自然产品化学
背景情况:
- 寨卡病毒 (ZIKV) 感染对全球健康构成重大挑战,原因是缺乏经批准的疫苗或抗病毒药物.
- 齐克病毒包裹 (E) 蛋白对于病毒进入宿主细胞至关重要,使其成为治疗干预的关键目标.
研究的目的:
- 使用计算选方法识别可以抑制ZIKV E蛋白质的天然黄化合物.
- 评估候选类黄类药物的药物相似性,ADMET概况,结合相互作用和复杂稳定性.
主要方法:
- 密度函数理论 (DFT) 计算用于黄胺结构优化和量子化学描述器分析.
- 在体选包括分子对接,QM/MM精细化和100ns分子动力学 (MD) 模拟.
- 具有约束力的自由能量计算 (MM-PBSA) 和主要成分分析 (PCA) 以评估结合亲和力和复杂稳定性.
主要成果:
- 奎尔塞丁,皮诺森布林和纳灵宁被确定为ZIKV E蛋白质的顶级结合剂,其对接得分高 (分别为-8.3,-8.1和-8.0卡路里/mol).
- 这些类黄体表现出有利的药理动力学特征,包括良好的吸收,高效的清除和低毒性.
- 皮诺克伦布林在100毫秒的MD模拟中表现出最稳定的结合形状.
结论:
- 奎尔塞丁,皮诺森布林和纳灵宁是ZIKV E蛋白质的有希望的天然抑制剂,证明了有效的目标参与.
- 这些化合物具有有利的类似药物的特性,这表明它们具有作为新型抗病毒药物的发展潜力.
- 建议进行进一步的体外和体内研究,以验证这些黄类候选物对ZIKV的疗效和安全性.
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