在 Salivary Gland Adenoid Cystic Carcinoma 中的基因表达程序使用单细胞和空间转录学分析
Ifeoma Ebinumoliseh1, Gopikrishnan Bijukumar1, Kendall Hoff1,2
1Department of Chemistry and Chemical Biology, University of New Mexico, Albuquerque, NM, 87131, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|September 15, 2025
概括
这项研究使用空间转录学来揭示唾液腺腺囊性癌 (SGACC) 的复杂细胞格局. 这些发现突出了瘤异质性和微环境相互作用,为这种侵略性癌症提供了新的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 唾液腺腺囊性癌 (SGACC) 是一种具有不良结果的侵袭性癌症,通常涉及多个瘤克隆和转移.
- 现有的研究依赖于批量和单细胞RNA测序,缺乏空间分辨率来理解瘤异质性.
- 了解空间转录格局对于开发针对SGACC的向疗法至关重要.
研究的目的:
- 执行SGACC的高分辨率空间转录组分析.
- 描述癌细胞种群及其微观环境.
- 为了确定治疗策略的新型转录特征和分子相互作用.
主要方法:
- 使用Visum HD在2μm分辨率下分析单细胞 (n=4) 和空间转录组学 (n=5) 样本.
- 多omics方法结合单细胞和空间转录组数据.
- 在瘤微环境中对瘤细胞群体,血和T细胞进行分析.
主要成果:
- 空间映射揭示了显著的细胞异质性和组织环境对转录组学的影响.
- 确定了关键驱动因素,包括MYB-NFIB融合和细胞外矩阵重塑和自的基因上调.
- 在MYB表达集群中检测到部分上皮层-介质细胞过渡 (P-EMT),以及PI3K-AKT,IL-17和Wnt信号通路的改变.
结论:
- 空间转录组学为SGACC复杂的监管环境和细胞动态提供了关键的见解.
- 识别了新的转录特征和微环境特征,这些特征并未通过传统方法捕获.
- 这些发现提供了潜在的治疗漏洞,并为SGACC更精确,更有针对性的治疗策略铺平了道路.
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