在aptamer选择中测试三维cyclooctatetraene的核基修饰
Greta Charlotte Dahm1, Usman Akhtar1,2, Alix Bouvier-Müller1
1Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3523, Department of Structural Biology and Chemistry, Laboratory for Bioorganic Chemistry of Nucleic Acids, Paris Cedex 15, France.
Communications chemistry
|September 15, 2025
概括
研究人员使用cyclooctatetraene carboxylate (COTc) 修饰开发了新型的体. 这些体表现出对PvLDH生物标志物的增强结合亲和力,在药物发现中为传统芳香化合物提供了一个有希望的替代品.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 药用化学 医学化学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 通过对aptamer进行修改,通过启用替代的结合方式来增强结合特性.
- 目前的修改通常模仿氨基酸侧链或使用sp2混合的部分.
- 药物发现趋势倾向于使用富含sp3的化合物而不是芳香衍生物.
研究的目的:
- 为了探索循环甲基烯碳酸盐 (COTc) 改性核酸在体开发中的实用性.
- 为了识别与Plasmodium falciparum乳酸脱酶 (PvLDH) 生物标志物的高亲和度阿胺.
- 评估COTc作为功能性核酸中芳香部分的生物异.
主要方法:
- 通过指数式丰富 (SELEX) 系统进化子被使用.
- 核酸被修改为循环甲基烯碳酸盐 (COTc).
- 通过测量解离常数来确定生成的阿普坦的结合亲和度.
主要成果:
- 成功识别了针对PvLDH的新型受体.
- 这些体表现出低纳米 (nM) 范围内的解离常数.
- 性能超过了之前识别的立方体.
结论:
- 环氧甲甲烯碳酸盐 (COTc) 是有效的aptamer修改.
- 经COTc修饰的体表现出对PvLDH的更好的结合亲和力.
- COTc 作为一种有价值的生物质,用于体和小分子中的芳香基.


