量化APOL1,人类白细胞抗原和其他对无法解释的功能衰竭的遗传贡献
Omid Sadeghi-Alavijeh1, Melanie M Y Chan2, Konstantinos Tzoumkas1
1Centre for Genetics and Genomics, UCL Department of Renal Medicine, UCL Medical School, London, United Kingdom.
概括
全基因组测序 (WGS) 确定了17%的不明原因功能衰竭 (uKF) 病例的遗传原因. 这项研究强调了APOL1基因变异在非洲血统的个体中的重要作用,这表明了UKF的独特遗传基础.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 腎臟病學 (nephrology) 是一種醫學專業.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 无法解释的功能衰竭 (uKF) 占置换治疗需求的15%,导致诊断不确定性.
- 确定UKF的遗传基础对于复发风险,家族评估和临床试验资格至关重要.
研究的目的:
- 确定导致无法解释的功能衰竭 (uKF) 的遗传变异.
- 研究特定基因变异和多基因风险评分 (PRS) 在UKF病因学中的作用.
主要方法:
- 全基因组测序 (WGS) 在218名50岁前KKF发病的患者中进行.
- 候选病原体变异被确定并对病原性进行评估,包括单个和结构变异.
- 病例控制关联分析使用180个非单一的KKF病例和26,373个对照进行,以及APOL1基因型和PRS评估.
主要成果:
- 通过WGS.在17% (38/218) 的患者中确立了单基性诊断.
- 高风险的APOL1基因型在近期非洲血统的KF患者中明显更为普遍 (52%对8.4%,P<0.001).
- 在具有高风险APOL1基因型的KKF患者中观察到对类固醇敏感性性综合征的多基因风险得分增加.
结论:
- 全基因组测序成功地在相当一部分KF患者中确定了单基因原因.
- 这项研究证实了APOL1变种在非洲血统的个人中在UKF中发挥的关键作用.
- uKF的遗传结构似乎与慢性病的常见形式不同.
