用RT-qPCR分析对Gynostemma pentaphyllum的参考基因进行查和验证,在不同的组织和不同的治疗条件下进行RT-qPCR分析
Yunyi Zhou1, Qiuyuan Meng2, Lixiang Yao1
1Guangxi TCM Resources General Survey and Data Collection Key Laboratory/ the Center for Phylogeny and Evolution of Medicinal Plants, National Center for TCM Inheritance and Innovation, Guangxi Botanical Garden of Medicinal Plants, Nanning, China.
Molecular biology reports
|September 20, 2025
概括
这项研究确定了Gynostemma pentaphyllum中最稳定的基因参考基因,用于准确的基因表达分析. 建议EF-1α用于各种组织,而UBC最适合非生物应激条件.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 生物技术是生物技术.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- Gynostemma pentaphyllum是一种有价值的药用植物,具有组织特异性的二次代谢物积累.
- 无生物因素会影响代谢物水平,但分子机制尚不清楚.
- 定量逆转录PCR (RT-qPCR) 需要稳定的基因参考来进行准确的基因表达分析.
研究的目的:
- 在G. pentaphyllum中识别和验证RT-qPCR的稳定参考基因.
- 评估基因表达在各种组织和非生物压力条件中的稳定性.
- 为精确的分子研究奠定了基础G. pentaphyllum.
主要方法:
- 为RT-qPCR分析选择了12个候选参考基因.
- 在各种组织 (叶子,树叶,茎,根,花,果实,) 中测试了基因稳定性.
- 在非生物应力下评估的稳定性: (Cd),甲基斯酸盐 (MeJA) 和Cd + MeJA联合治疗.
- 使用geNorm,NormFinder,BestKeeper和RefFinder算法进行全面的分析.
主要成果:
- EF-1α被确定为不同组织中最稳定的参考基因.
- 在Cd和MeJA压力条件下,UBC表现出最高的稳定性.
- CYP表现出最低的稳定性,使其不适合作为参考基因.
- 使用GpFPS和GpSE表达分析验证了选择的参考基因的适用性.
结论:
- 这项研究为G. pentaphyllum中准确的RT-qPCR提供了经过验证的参考基因.
- 在各种发育和压力条件下实现可靠的基因表达概况.
- 促进了对G. pentaphyllum分子机制的更深入的理解.
