Erwinia wuhanensis sp. 这种植物的生长方式. Nov. 从人类血液中分离出来

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 细菌的分类学 细菌的分类学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 一种新型细菌菌株,BC051422^T,从中国武汉的一名患者的血液中分离出来.
• 隔离物表现出Erwinia*属的特征,需要进一步的分类学研究.

研究的目的:

• 在分类学上描述和分类新的Erwinia菌株BC051422^T.
• 为了确定BC051422^T菌株是否代表了Erwinia*属内的新物种.

主要方法:

• 现型表征包括Gram染色,运动性和代谢试验 (糖糖发酵,曼诺糖代谢).
• 使用16S rRNA基因测序的基因型分析,对家政基因的多位置测序分析 (MLSA) (*atpD, infB, rpoB, gyrB*).
• 全基因组测序以确定平均核酸标识 (ANI) 和in silico DNA-DNA杂交 (isDDH) 值.

主要成果:

• 基因组分析 (ANI和isDDH) 显示,与已知的*Erwiniaceae*相比,物种划分的值低于已确定的值.
• 该菌株的主要细胞脂肪酸和G+C含量 (55.95mol%) 与*Erwinia*物种一致.
• 独特的代谢特征:糖糖的发酵,而不是曼诺斯,拉姆诺斯,梅利比奥斯或索尔比托,使其与相关物种有所区别.

结论:

• 综合的基因型和表型数据强烈支持将BC051422^T菌株归类为新物种.
• 这种新物种的拟议名称是*Erwinia wuhanensis* sp. nov.,与BC051422^T作为类型菌株.