从MS1到结构:一个基于香味的Van Krevelen-DBE框架,用于通过高分辨率质谱测量来说明专门的代谢物
Nerilson M Lima1, Luana A Pereira1, Lucas S Tironi1
1Institute of Chemistry, Federal University of Alfenas, Alfenas, Minas Gerais, Brazil.
这项研究引入了一种新的化学信息框架,用于使用高分辨率质谱 (HRMS) 数据对特殊代谢物进行分类. 该方法在复杂样本中提高了代谢物注释的可靠性,而不需要MS2碎片.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 化学信息学是一种化学信息学.
- 自然产品化学 自然产品化学
背景情况:
- 未定位的代谢学在仅使用MS1高分辨率质谱 (HRMS) 数据来分类专门的代谢物方面面临挑战.
- 传统的范克雷文图缺乏分辨率来区分结构上相似的代谢物类.
研究的目的:
- 开发一种化学信息框架,以在MSI 3级精制代谢物类注释.
- 从MS1 HRMS数据中增强专门代谢物的分类.
主要方法:
- 综合范克雷文分析 (H/C与O/C) 与双重债券等价值 (DBE) 计算.
- 使用来自数据库和天然产品存储库的精选分子公式.
- 分析了600多个分子,类和异类分子公式的数据集,以定义特定类型的模式.
主要成果:
- 通过使用DBE和Van Krevelen图表,改善了重叠的代谢物类 (例如,黄类,酸,氨酸,氨酸,氨酸) 之间的区分.
- 揭示了传统MS1工具无法捕捉的芳香度和不和度的结构趋势.
- 超越现有的3级注释策略,并在Eugenia jambolana水果提取物的案例研究中得到验证.
结论:
- 开发了第一个可扩展的框架,用于仅从MS1数据中注释专门的代谢物.
- 集成的元素比率和结构描述符,以提高注释的可靠性.
- 适用于复杂的,缺乏特征的矩阵,如植物提取物,而不需要MS2碎片化.
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