废水测序揭示了德克萨斯州各地几个致癌病毒的持续循环和不断增加的流行率
Harihara Prakash1,2, Ryan K Perez1, Matt Ross1,3
1Department of Molecular Virology and Microbiology, Baylor College of Medicine, Houston, TX.
medRxiv : the preprint server for health sciences
|September 26, 2025
概括
废水监测检测到德克萨斯州有6种已知和3种可疑的致癌病毒,揭示了HPV和EBV等高风险病毒的流行率越来越高. 这种混合捕获方法为公共卫生提供了致癌病毒的可扩展跟踪.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
背景情况:
- 在全球范围内,致癌病毒导致近20%的人类癌症.
- 对于致癌病毒,基于废水的病毒流行病学 (WBE) 数据有限.
- 目前针对WBE的有针对性的PCR方法缺乏可扩展性.
研究的目的:
- 实施WBE使用混合捕获探头,同时检测和跟踪多种致癌病毒.
- 为了克服目标WBE方法的可扩展性限制.
- 监测德克萨斯州废水中的瘤病毒动态.
主要方法:
- 在三年内 (2022年5月至2025年5月) 收集废水样本.
- 采用混合捕获方法来检测,过和测序致癌病毒.
- 利用计算工具进行病毒表征,丰富度跟踪和基因组覆盖率测量.
主要成果:
- 在德克萨斯州检测到六种已知和三种可疑的致癌病毒.
- 观察到病毒数量在三年内逐渐增加,有季节性峰值.
- 在2024年后,HPV和EBV等高风险病毒的急剧增加,几乎实现了100%的基因组覆盖.
结论:
- 混合捕获WBE有效地追踪多种致癌病毒,克服了有针对性的方法的限制.
- 证明了持续的循环和高风险致癌病毒的患病率上升.
- 强调需要对高风险人群进行持续的公共卫生干预和监测.
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