在Vigna mungo的不同发展阶段和压力条件下的qRT-PCR数据中确定最好的家政基因以实现正常化
Sudhir Kumar Jha1, Pritee Sagar1, Prateek Kumar1
1Division of Plant Biotechnology, ICAR-Indian Institute of Pulses Research, Kanpur, India.
Scientific reports
|September 26, 2025
概括
这项研究确定了最稳定的家政基因 (HKGs),用于在Vigna mungo中规范定量实时PCR (qRT-PCR) 数据. 推RPS34和RHA用于发育阶段,而ACT2和RPS34最适合非生物压力条件.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因表达分析 基因表达分析
背景情况:
- 定量实时PCR (qRT-PCR) 对于基因表达造型至关重要.
- 准确的mRNA量化依赖于稳定的内部控制基因进行正常化.
- 维格纳蒙古 (大豆/黑豆) 缺乏已确立的稳定家政基因,用于qRT-PCR.
研究的目的:
- 识别和验证Vigna mungo中最稳定的QRT-PCR的家庭基因.
- 评估在不同发育阶段和非生物压力条件中的基因稳定性.
- 确保Vigna mungo研究中可靠和一致的基因表达数据.
主要方法:
- 评估了14个候选的家政基因 (UFO,TUB2,ACT2,RHA,ISTL6,CyP,DNAJ,RBCS3B,RPS34,USP21,USB1,EfTu,UBQ10,UBQE9) 进行了评估.
- 使用geNorm,NormFinder,BestKeeper,比较 ΔCt 和 RefFinder 算法评估基因表达稳定性.
- 在独立实验中验证了选择的候选基因.
主要成果:
- RPS34和RHA被确定为所有发育阶段正常化qRT-PCR数据的最稳定的基因.
- 在非生物应激条件下,ACT2和RPS34表现出最佳的稳定性.
- 验证证实了这些候选家政基因的适用性.
结论:
- 建议使用RPS34和RHA来使发育中的维格纳果组织中的qRT-PCR数据正常化.
- 建议ACT2和RPS34用于压力处理的Vigna mungo组织中的qRT-PCR数据的正常化.
- 鉴定到的参考基因提高了维格纳果中qRT-PCR结果的可靠性和一致性.
