基于MeRIP-Seq分析的横向大动脉收缩诱导心脏纤维化中N6-甲基氨酸甲基化的综合分析

科学领域:

• 心血管生物学 心血管生物学
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 分子医学是分子医学.

背景情况:

• 压力过载心脏纤维化机制尚未完全理解.
• 在这个过程中N6-甲基氨酸 (m6A) 甲基化的作用尚不清楚.

研究的目的:

• 分析和预测在经过横向大动脉收缩 (TAC) 的小鼠心脏中的m6A修饰.
• 为了确定关键的基因和监管网络参与TAC诱导的心脏纤维化.
• 探索心脏纤维化潜在的治疗点.

主要方法:

• 小鼠接受了TAC或假手术.
• 通过使用RNA Dot Blot.评估全球m6A水平.
• 通过RT-PCR和西式涂抹量化m6A相关酶表达.
• 执行了MeRIP-seq和RNA-seq以识别差异修饰和表达的基因.
• 构建的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI),TF-miRNA协同调节和药物中心基因网络.
• 进行了分子对接模拟.

主要成果:

• TAC导致全球m6A甲基化升高和m6A调节剂的表达变化 (METTL3,METTL14上调;FTO,ALKBH5下调).
• 确定了66个基因,同时发生了m6A修饰和mRNA表达的变化.
• 通过PPI网络分析确定了六个枢纽基因 (Cd33, Irf4, Nr4a2, Hspa1b, Nr4a1, Adcy1).通过PPI网络分析确定了六个枢纽基因 (Cd33, Irf4, Nr4a2, Hspa1b, Nr4a1, Adcy1).
• 开发了TF-miRNA和药物中心基因相互作用网络.

结论:

• m6A修饰在TAC诱导的心脏纤维化中起着重要作用.
• 已识别的枢纽基因和调节网络在纤维化过程中至关重要.
• m6A修饰代表了心脏纤维化的潜在治疗标.