在Mycobacterium tuberculosis中药物耐药性突变的表征从摩洛哥患者中分离出来,使用Deeplex目标下一代测序

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 结核病 (TB) 构成了重大的全球卫生挑战,因抗药性Mycobacterium tuberculosis (MTB) 菌株的增加而加剧.
• 摩洛哥面临越来越多的耐药结核病负担,需要先进的诊断和监测方法.

研究的目的:

• 在摩洛哥进行第一个全国性的MTB临床分离物的分子表征.
• 利用Deeplex-MycTB针对下一代测序 (tNGS) 试验进行抗性突变检测和植物遗传学分析.

主要方法:

• 分析了71个来自摩洛哥结核病患者的培养衍生DNA样本.
• 使用Deeplex-MycTB tNGS检测18个基因中与耐药性相关的突变.
• 确定MTB的遗传谱系的确定.

主要成果:

• 68个可解释样本中有75%显示与耐药性相关的突变.
• 78%的耐药隔离物是多药耐药结核病 (MDR-TB),其中25.5%被归类为前广泛耐药结核病 (XDR-TB前).
• 主要突变在rpoB,katG,inhA和pncA中,与对一线药物耐药性相关;4.3系 (欧美) 流行.

结论:

• 针对性下一代测序 (tNGS) 对于快速检测耐药性和摩洛哥结核病的分子监测是有效的.
• 研究结果支持使用tNGS来指导个性化结核病治疗,并为国家控制战略提供信息.
• 这项研究提供了关于摩洛哥MTB耐药性模式和植物遗传多样性的关键数据.