SRC是Arctigenin在治疗三阴性乳腺癌的潜在目标:基于机器学习算法,分子建模和体外试验

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 药理学 药理学是指药理学的学科.

背景情况:

• 三阴性乳腺癌 (TNBC) 是一种具有有限向治疗选择的侵袭性亚型.
• 素 (AG) 是一种具有潜在抗癌性能的天然化合物.
• 阐明TNBC中AG的分子机制对于治疗开发至关重要.

研究的目的:

• 研究Arctigenin (AG) 对三阴性乳腺癌 (TNBC) 的治疗疗效.
• 确定通过AG发挥其抗TNBC作用的分子标和途径.
• 用计算和实验方法验证AG与关键分子标的相互作用.

主要方法:

• 生物信息分析包括目标识别,差异基因表达和权重基因联合表达网络分析 (WGCNA).
• 机器学习算法用于枢纽基因识别.
• 分子对接,分子动力学 (MD) 模拟和表面等离子体共振 (SPR) 试验用于目标验证.
• 在TNBC细胞系 (MDA-MB-453,MDA-MB-231) 的体外实验,包括细胞活力,细胞循环,细胞亡测定和西部抹杀.

主要成果:

• 鉴定了183个AG相关的标和关键的TNBC相关基因.
• 机器学习确定了4个枢纽基因,其中SRC激酶通过分子对接,MD和SPR与AG显著相互作用.
• 在体外研究表明,AG抑制TNBC细胞活力,诱导S相停止和亡.
• AG治疗降低了参与细胞存活和增殖的关键蛋白质的调节,包括Bcl-2,SRC,PI3K/AKT和MEK/ERK信号通路.

结论:

• 阿基基宁 (AG) 显示出显著的抗TNBC活性.
• AG直接与SRC激酶结合,抑制其活性.
• AG的抗癌作用通过同时抑制PI3K/AKT和MEK/ERK信号通路进行介导,从而导致TNBC细胞的细胞周期停止和细胞亡.