使用动物肠道内容的metatranscriptomic测序检测到植物生物安全威胁
Jackie E Mahar1,2, Jonathon C O Mifsud1, Kate Van Brussel1
1School of Medical Sciences, University of Sydney, Sydney, NSW 2006, Australia.
Virus evolution
|September 29, 2025
概括
哺乳动物的肠道转录酶可以检测出Ribgrass马赛克病毒 (RMV) 和相关的托巴莫病毒,有助于生物安全监测. 这项研究在澳大利亚野生动物中发现了五种托巴莫病毒,揭示了它们的传播和演变.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
- 生态生态学 生态生态学
背景情况:
- 肋草马赛克病毒 (RMV) 和其他托巴莫病毒对全球园艺构成重大威胁.
- 目前澳大利亚对这些植物病原体的监测方法有限.
- 澳大利亚认为托巴莫病毒是外来生物安全威胁,需要采取严格的控制措施.
研究的目的:
- 研究使用哺乳动物肠道转录基因组检测RMV和相关的托巴莫病毒的潜力.
- 在澳大利亚野生动物中识别托巴莫病毒并评估其分布.
- 了解检测到的托巴莫病毒的进化起源和传播.
主要方法:
- 从各种澳大利亚哺乳动物的肠道样本 (东部灰色袋鼠,鹿,家养狗,斑尾,野猫,塔斯马尼亚魔鬼) 中分析的转录基因数据.
- 检测到的托巴莫病毒的鉴定和遗传学分析.
- 在甲转录基因组中检测托巴莫病毒.
主要成果:
- 在哺乳动物肠道转录组中发现了五种不同的托巴莫病毒,包括RMV,一种新的RMV亲属,两种新的分离托巴莫病毒和烟草温和绿色马赛克病毒 (TMGMV).
- 在甲转录组中也检测到了一种托巴莫病毒.
- 遗传学分析揭示了RMV在澳大利亚首都领土和塔斯马尼亚的分布,在ACT和新南威尔士的新型RMV亲属,新南威尔士和昆士兰的新型托巴莫病毒,以及昆士兰的TMGMV.
结论:
- 哺乳动物肠道转录基因组是监测植物生物安全威胁的可行工具.
- 该研究在澳大利亚野生动物中发现了托巴莫病毒,为其传播和演变提供了洞察力.
- 这种方法可以加强对影响本地和农业物种的植物病原体的监测.
