利用代表性不足的人口数据可以更好地解释与听力损失相关的遗传变异
Sun Young Joo1,2, Seung Hyun Jang1,2, Jung Ah Kim1,2
1Department of Pharmacology, Graduate School of Medical Science, Brain Korea 21 Project, Yonsei University College of Medicine, Seoul, 03722, Republic of Korea.
听力损失变种的遗传数据往往缺乏东亚代表性. 这项研究使用韩国和日本的人口数据将许多致病变异重新归类为良性,改善了对不同祖先的变异解释.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 基因组学就是基因组学.
- 听力学 听力学是指听力学.
背景情况:
- 听力损失具有遗传多样性,涉及超过121个基因.
- 现有的遗传数据库主要代表欧洲祖先,限制了其他种群的变异解释.
- 对罕见变异的准确解释需要特定于种群的小基因基因频率 (MAF) 数据.
研究的目的:
- 为了分析与非综合征性听力损失相关的罕见变体,使用韩国和日本个体的人口等位基因频率.
- 为了识别可能因缺乏多样化的人口数据而被错误地归类为致病变体的变体.
- 提高对代表性不足的祖先的遗传变异解释的准确性.
主要方法:
- 从9579名韩国人和54000名日本人的评估人口等位基因频率.
- 在聋变异数据库 (DVD) 中对病原性,可能病原性或不确定的意义进行分类的评估变异.
- 利用管道重新分类基于MAF数据的变体来自不同的人口.
主要成果:
- 在DVD中的6381种致病性/可能致病性变体中,在韩国人口中发现了216种.
- 31个变体显示高等位基因频率超过良性值;6个仍然引起疾病 (包括4个东亚创始基因基因).
- 24种变异被重新分类为良性/可能良性,在1,299,211种不确定的变异 (VUS) 中,有3,736种被重新分类为良性.
结论:
- 韩国人和日本人等代表性不足的人群的MAF数据对于准确的听力损失变体解释至关重要.
- 以前被认为具有病原性的大量变异被重新归类为良性.
- 突出了跨多元祖先的大规模测序的必要性,以改进听力损失的遗传诊断.
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