SPP1+ 在肝细胞癌中通过综合单细胞和批量转录基因分析获得巨相关的预后特征
Suyang Yue1,2, Qin Ding3, Shanzhong Tan1
1Department of Integrated TCM and Western Medicine, Nanjing Hospital Affiliated to Nanjing University of Chinese Medicine, Nanjing, China.
International journal of genomics
|October 1, 2025
概括
肝细胞癌 (HCC) 的预后因与SPP1+巨细胞相关的新七基因特征而得到改善. 这种生物标志物有助于预测患者的生存率,并指导肝癌的个性化免疫疗法策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 由于高死亡率和有限的治疗途径,肝细胞癌 (HCC) 构成了重大的全球健康挑战.
- 与瘤相关的巨细胞,特别是SPP1+子集,越来越多地被认为是瘤免疫微环境和HCC进展的关键调节者.
研究的目的:
- 为了确定参与HCC进展的关键免疫细胞子集.
- 开发一种与SPP1+巨相关的预后基因特征,用于HCC患者分层.
- 评估开发的患者生存签名的预测准确性.
主要方法:
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 与大量的转录组数据 (TCGA,ICGC) 的整合.
- 通过集群和体受体相互作用分析识别免疫细胞子集.
- 使用考克斯回归,拉索,生存分析,ROC曲线和AI框架构建和验证预后风险模型.
主要成果:
- 确定了12种不同的免疫细胞类型,突出显示了SPP1+巨细胞与瘤和免疫细胞的显著相互作用.
- 建立了一个强大的七基因签名 (SNX5,YBX1,GNPD1,RAB32,TPM3,ATP6V0B,RAB7A),有效地根据独立队列的生存风险对患者进行分层.
- 预后模型表现出高预测准确度,由强大的AUC值和基因表达和风险得分之间的显著相关性证明.
结论:
- 在调节免疫反应和驱动肝细胞癌的进展方面,SPP1+巨细胞是关键的.
- 开发的七基因特征作为HCC的可靠预后生物标志物.
- 这种与巨细胞相关的SPP1+签名有可能为个性化治疗策略和HCC的精密免疫疗法提供信息.
