CobVar-维生素B12相关基因组变异的全面资源
Neha H Suresh1, Chaitra A Kilpady1, Akshata A Kamath1
1Division of Nutrition, St. John's Research Institute, St. John's National Academy of Health Sciences, Sarjapur Road, Bengaluru, Bengaluru Urban District, Karnataka 560034, India.
遗传变异会影响维生素B12 (科巴胺) 状态. 在CobVar数据库系统地策划这些遗传关联,为研究B12生物标志物和个性化营养的研究人员提供了宝贵的资源.
科学领域:
- 营养基因组学 营养基因组学
- 生物化学 生物化学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 维生素B12 (科巴胺) 对于DNA合成和能源生产至关重要.
- 遗传变异会影响可巴拉明的代谢,影响B12状态.
- 需要一个结构化的资源来研究这些遗传因素.
研究的目的:
- 系统地策划和创建一个易于使用的网络数据库,对影响维生素B12生物标记物的遗传变异产生影响.
- 促进对B12状态的遗传影响的研究.
主要方法:
- 一项系统的PubMed搜索发现了493项关于5个B12特征的研究中的47篇相关出版物.
- 数据是手动精选的,以编译可巴胺相关遗传变异 (CobVar) 数据库.
- 该数据库是使用MongoDB构建的,其Web界面编码在PHP,JavaScript,HTML和CSS中.
主要成果:
- CobVar数据库包含5个B12特征的324个遗传变异关联,涉及222个独特变异和84个基因.
- 大约三分之一的关联是在多项独立研究中报告的.
- FUT2基因显示出对总血清/血B12的关联最多.
结论:
- CobVar数据库提供了对影响B12生物标志物的遗传变异的全面数据.
- 此资源有助于研究人员和营养学家了解与B12相关的遗传研究.
- CobVar支持推进个性化的营养和治疗策略.
更多相关视频
09:37Navigating MARRVEL, a Web-Based Tool that Integrates Human Genomics and Model Organism Genetics Information
Published on: August 15, 2019
11:35Screening for Functional Non-coding Genetic Variants Using Electrophoretic Mobility Shift Assay EMSA and DNA-affinity Precipitation Assay DAPA
Published on: August 21, 2016
相关概念视频
Comparing Copy Number Variations and SNPs
Copy number variations or CNVs are the structural variations that cover more than 1kb of DNA sequence. The single nucleotide polymorphism (SNP), on the other hand, is a single nucleotide change or a point mutation that is found in more than 1%...
Genome-wide Association Studies-GWAS
GWAS does not require the identification of the target gene involved in...
Single Nucleotide Polymorphisms-SNPs
Histone Variants at the Centromere
Human Genetics
The complex relationship between genetics and psychology is observable through common biological components such...
Genomics
