养殖的死亡率跟随着Vibrio社区的持续重组
Steph Smith1, Mark Ciesielski1, Thomas Clerkin1
1Department of Earth, Marine and Environmental Sciences, Institute of Marine Sciences, University of North Carolina, Morehead City, North Carolina, USA.
海洋双动物死亡事件显示出可预测的Vibrio细菌社区转移. 失去Vibrio mediterranei可能是即将到来的疾病的信号,为水产养殖提供了早期预警.
科学领域:
- 海洋微生物学和水产养殖疾病生态学.
- 细菌群体的基因组和遗传学分析.
背景情况:
- 海洋双动物死亡事件导致水产养殖业的重大经济损失.
- 驱动这些死亡事件的微生物动态尚不清楚.
- 东部 (Crassostrea virginica) 容易发生无法解释的死亡事件.
研究的目的:
- 为了调查死亡事件期间的Vibrio社区继承模式.
- 为了了解Vibrio社区在疾病进展过程中发生的基因组基础的变化.
- 确定贝类水产养殖中早期预警系统的潜在生物指标.
主要方法:
- 在两年内,从26只中分离出110个Vibrio分离物的全基因组测序.
- 遗传学分析以识别保存的类和它们的时间关联.
- 对比基因组分析,以比较类别之间的代谢和毒性途径.
主要成果:
- 六个保存的Vibrio遗传基团在死亡期间显示出明显的时间关联.
- 维布里奥地中海和居民维布里奥在早期阶段占主导地位;其缺席与其他维布里奥物种的丰富性增加相吻合.
- 基因组分析显示,随着死亡率的增长,从宿主殖民路径向毒性机制的转变.
结论:
- 在死亡期间,从开始性到潜在的致病性Vibrio物种的可预测继承发生.
- 在严重死亡之前Vibrio mediterranei的持续丧失表明其作为早期生物指标的潜力.
- 监测Vibrio社区的转移可以改善水产养殖疾病管理,减轻经济损失.
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