一个基于选择的淘汰赛方法,可诺菌体揭示了由河马信号调节的多细胞发育

科学领域:

• 进化生物学 进化生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 细胞生物学 细胞生物学

背景情况:

• 藻类是动物的最近的亲属,为早期动物进化提供了洞察力.
• 对于理解动物起源而言,多细胞状藻Salpingoeca rosetta的基因改造至关重要.
• 对于S. rosetta,现有的淘汰 (KO) 方法是低效和耗时的.

研究的目的:

• 为Salpingoeca rosetta开发一种基于CRISPR-Cas9的快速和强大的淘汰 (KO) 方法.
• 调查S. rosetta中关键发育调节器和Hippo通路同类的功能.
• 探索河马信号在调节多细胞大小和细胞外基因矩阵基因中的作用.

主要方法:

• 利用CRISPR-Cas9基因编辑来创建S. rosetta中的目标基因淘汰.
• 打断或替换编码序列与抗生素耐药性磁带进行选择.
• 进行RNA测序以分析淘汰突变物中的基因表达变化.

主要成果:

• 成功为三个发育调节器 (rosetteless,couscous,jumble) 和两个Hippo通路同类 (,yorkie) 生成KO线.
• 观察到的淘汰赛花束比野生类型大得多.
• RNA测序表明和约克调节细胞外基因基因,包括库斯库斯,这表明河马途径参与了基因分泌和多细胞尺寸控制.

结论:

• 开发的CRISPR-Cas9方法为S. rosetta的功能遗传学提供了快速有效的工具.
• 河马信号通路的组成部分 (,约克) 在调节小旗虫的多细胞大小方面发挥着作用.
• 这种方法有可能大大加快对花生物和动物起源的研究.