作为登革热病毒复制抑制剂的抗癌类黄素的体鉴定:一种分子对接和仿真方法
Soumendu Patra1, Arindam Paul2, Harshita Shand1
1Infection and Disease Biology Laboratory, Department of Microbiology, Raiganj University, Raiganj, West Bengal, 733134, India.
Journal of molecular modeling
|October 4, 2025
概括
这项研究确定了天然化合物Artobiloxanthone和Glabridin作为潜在的登革热病毒抑制剂. 计算方法证实了它们与关键病毒蛋白NS3和NS5的稳定相互作用,表明了新的抗病毒药物开发途径.
科学领域:
- 计算机化药物发现.
- 病毒学 病毒学
- 药品化学 药品化学 是一个
背景情况:
- 登革热病毒对全球健康构成重大威胁,需要新的抗病毒策略.
- 病毒蛋白NS3 (酶) 和NS5 (依赖RNA的RNA聚合酶) 是登革热抗病毒开发的关键标.
- 现有的抗病毒工作表现出有限的成功,突出显示出需要新的治疗方法.
研究的目的:
- 研究天然抗癌类黄化合物作为登革热病毒NS3和NS5蛋白的抑制剂的潜力.
- 通过in silico方法识别特定的黄化合物,这些化合物可以有效地与这些病毒标结合和破坏稳定.
主要方法:
- 329种抗癌类黄素对登革热病毒NS3和NS5蛋白质的虚拟查.
- 应用Lipinski的五个规则和其他过器来选择化合物.
- 分子对接,ADMET预测和分子动力学 (MD) 模拟以评估结合亲和力和稳定性.
- 使用MM-PBSA方法进行具有约束力的免费能源计算,以进行可靠的验证.
主要成果:
- 确定阿尔托比洛克桑是NS3最强大的抑制剂,格拉布里丁是NS5.
- 选择的化合物表现出有利的ADMET配置文件.
- MD模拟显示了稳定的蛋白质-连接体相互作用,在200 ns (NS3) 和470 ns (NS5) 时实现了收.
- MM-PBSA计算证实了强烈的结合亲和关系.
结论:
- 阿尔托比洛克桑和格拉布里丁作为登革热病毒复制的新型抑制剂显示出显著的希望.
- 这些化合物代表了开发新的登革热抗病毒疗法的潜在线索.
- 在 silico 方法是有效的,以确定基于天然产品的抗病毒药物候选人.
