基于外体蛋白质组学,对肝细胞癌的分子亚型和治疗预测
Mingsong Mao1, Ze Zhang2, Yao Zhang3
1School of Basic Medical Sciences, Anhui Medical University, Hefei, 230032, China; State Key Laboratory of Medical Proteomics, National Center for Protein Sciences (Beijing), Academy of Military Medical Sciences, Research Unit of Proteomics & Research and Development of New Drug of Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing, 102206, China.
International journal of biological macromolecules
|October 4, 2025
概括
这项研究使用外体蛋白确定了肝细胞癌 (HCC) 的两个分子亚型. 一个机器学习模型预测了患者的结果和治疗反应,为精确瘤学提供了一个新的非侵入性生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 的精密药物需要分子亚型.
- 组织活检在捕捉瘤异质性和时间变化方面存在局限性.
研究的目的:
- 使用外体蛋白质将HCC患者分类为分子亚型.
- 开发一种非侵入性模型来预测患者的生存率和治疗反应.
主要方法:
- 利用患者衍生异种移植 (PDX) 模型来隔离外体蛋白质.
- 应用差异表达分析,生存查和Boruta特征选择来识别关键蛋白质.
- 开发了一种机器学习模型 (TSExs),集成14种蛋白质,用于预后和预测准确性.
主要成果:
- 确定了两个强大的HCC亚型 (S1和S2),具有不同的免疫微环境.
- S1瘤显示抗原呈现和T细胞激活的增加,但清除受损.
- 在S2瘤中,免疫透率较低,但免疫媒介消除效率更高.
- 该TSExs模型显示出高预后准确性,并预测了跨队列的治疗反应.
结论:
- 建立了一个非侵入性框架,用于使用外体蛋白的免疫分析和HCC的治疗预测.
- 外体蛋白显示出临床潜力,作为HCC精密瘤学的生物标志物.
- TSExs模型支持HCC的个性化治疗决策.
