通过人工智能和分子动力学模拟方法驱动的选择性HDAC6抑制剂的发现
Xingang Liu1,2, Hao Yang2, Xinyu Liu2
1Department of Pharmacology, Hebei Medical University, Shijiazhuang, 050017, China.
Journal of pharmaceutical analysis
|October 6, 2025
概括
人工智能和分子模拟确定了Cmpd.18作为激素脱乙酶6 (HDAC6) 的强有力的抑制剂,在细胞中显示出抗癌作用和药物开发潜力.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 计算化学计算化学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 基因组脱乙酶6 (HDAC6) 功能障碍与各种疾病,特别是癌症有关.
- 准HDAC6是开发新型抗癌药物的有希望的策略.
研究的目的:
- 利用人工智能和分子模拟开发一个高效的药物查管道.
- 确定和描述具有抗瘤潜力的新型HDAC6抑制剂.
主要方法:
- 集成AI与分子模拟,包括化合物-蛋白相互作用预测,分子对接和分子动力学 (MD) 模拟.
- 通过酶和细胞活动测定来评估生物潜力.
- 分析了使用MD模拟和自由能量分解的结合机制.
主要成果:
- Cmpd.18表现出强大的HDAC6抑制 (IC50 = 5.41 nM) 和对HDAC1的选择性 (选择性指数≈117.23).
- 在HCT-116细胞中,Cmpd.18诱导了G2/M阶段停止和亡,表现出显著的抗增殖活性 (IC50 = 2.59μM).
- 通过MD模拟,通过关键残留物阐明了Cmpd.18通过关键残留物与HDAC6活性口袋的稳定结合.
结论:
- 由人工智能驱动的开发管道有效地确定了Cmpd.18作为一个有前途的HDAC6抑制剂.
- Cmpd.18表现出显著的抗癌性质和有利的结合机制,需要进一步研究.
- 这种2−−2−基乙 (pyridazin−3−2−H) 一基架显示出开发新型HDAC6向疗法的潜力.
