循环瘤细胞的单细胞RNA测序:工作流程和翻译应用的实用指南
Francis Yew Fu Tieng1, Learn-Han Lee2,3, Nurul-Syakima Ab Mutalib4,5
1Department of Clinical Oncology, Faculty of Medicine, University of Malaya (UM), 50603, Kuala Lumpur, Malaysia. francistieng@um.edu.my.
Cancer metastasis reviews
|October 6, 2025
概括
这项研究引入了一种标准化的12步工作流程,用于循环瘤细胞 (CTC) 的单细胞RNA测序 (scRNA-seq),以改善癌症转移研究. 该工作流处理不一致性,并指导工具选择,以更好地检测罕见细胞群.
科学领域:
- 癌症研究 癌症研究
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 全球癌症负担的增加与转移和治疗失败有关.
- 循环瘤细胞 (CTC) 是转移级联中的关键前体.
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 提供了对CTCs的高分辨率转录学见解.
研究的目的:
- 解决CTC scRNA-seq研究中的知识缺口和方法不一致的问题.
- 为CTC scRNA-seq.提出一个标准化的12步工作流程.
- 为指导工具选择和促进数据共享,以促进转移研究中的可复制性.
主要方法:
- 开发一个全面的12步CTC特定的scRNA-seq工作流程.
- 详细编译和评估CTC scRNA-seq.q.的数据分析工具.
- 讨论新兴的前沿领域,如混合细胞和机器学习集成.
主要成果:
- 提出了一个标准化的工作流程,以克服CTC scRNA-seq协议中的不一致性.
- 对scRNA-seq工具的评估为CTC研究应用提供了指导.
- 确定未来研究的关键领域,包括标准化和ML集成.
结论:
- 标准化CTC scRNA-seq工作流程对于推进转移研究至关重要.
- 整合机器学习和研究罕见/混合细胞种群将提高理解.
- 拟议的工作流程和工具指导方便可重复和有影响力的CTC研究.
