沙门氏菌血清Infantis REPJFX01分离物携带一个pESI等离子体,其中包括在密切相关的非REP菌株中没有发现的额外基因
Anna Schumann1,2, Martin Wiedmann1, Renato H Orsi1
1Department of Food Science, Cornell University, Ithaca, New York, USA.
Microbial genomics
|October 7, 2025
概括
一种与家禽和旅行相关的多抗药沙门氏菌 (REPJFX01) 菌株表现出特定的遗传特征,包括与等离子体相关的基因. 这些遗传因素可能会推动它的出现和全球传播.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 食品安全 食品安全
背景情况:
- 沙门氏菌 (Salmonella enterica) 的一个亚种. 输入式血清Infantis (S. Infantis) REPJFX01是一种多药耐药菌株.
- 这种菌株被美国疾病控制和预防中心指定为复发性,新兴性和持久性 (REP) 菌株,因为它与食源性疾病和疫情有关.
研究的目的:
- 将S. Infantis REPJFX01的基因组与非REP S. Infantis分离物进行比较.
- 为了确定与REPJFX01菌株有显著关联的基因.
主要方法:
- 对公开可用的S. Infantis REPJFX01基因组进行比较基因组学分析.
- 与来自同一NCBI SNP集群的非美国分离物和来自其他SNP集群的分离物进行比较.
主要成果:
- 与非REP分离物相比,有135个基因与REPFX01菌株有显著的关联 (P<0.001).
- 其中50个与REP相关的基因位于质粒上.
- 功能注释揭示了参与转录,重组,和抗菌素耐药性的基因.
结论:
- 携带抗性基因的移动元素的获取可能促进了S. Infantis REPJFX01.01的出现和传播.
- REPJFX01存在于北美和南美,突出了对REP菌株的国际监测和观点的需要.
